बेबी कॉर्न में खाद का प्रयोग उचित पोषक तत्वों की पूर्ति के लिए किया जाता है, जिससे पौधे का समुचित विकास हो सके। ऑर्गेनिक सब्जियां उगाने और पौधों के अच्छे विकास के लिए जैविक उर्वरक अर्थात ऑर्गेनिक फर्टिलाइजर का उपयोग किया जाता है।